Zoospora adalah spora aseksual berfagel yang diproduksi oleh protista, bakteri, dan jamur di mana flagelum memberikan pergerakan ke zoospora sementara zigospora adalah tahap diploid dari siklus reproduksi banyak jamur dan protista yang dibentuk oleh sel-sel haploid melalui fisi inti. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan utama antara zoospora dan zigospora. Lebih lanjut, zoospora adalah struktur haploid sedangkan zigospora adalah struktur diploid. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan signifikan antara zoospora dan zigospora.

Selain itu, perbedaan lebih lanjut antara zoospora dan zigospora adalah zoospora adalah spora terbuka tanpa dinding spora yang signifikan, tetapi zigospora memiliki dinding spora tebal. Yang penting, zoospora bergerak karena adanya flagela sedangkan zigospora tidak motil karena tidak ada flagela yang ada di dalamnya. Jadi, ini juga perbedaan penting antara zoospora dan zigospora adalah motilitas.

Spora seperti zoospora dan zigospora adalah struktur reproduksi. Zoospora adalah spora aseksual yang diproduksi oleh protista, bakteri, dan jamur. Selain itu, mereka memiliki flagela dan spora motil. Sebaliknya, zigospora adalah spora non-motil. Mereka adalah tahap diploid dari siklus reproduksi banyak jamur dan protista. Perbedaan utama antara zoospora dan zigospora adalah tingkat ploidi mereka. Zoospora adalah haploid sedangkan zigospora diploid.