Setiap endonuklease restriksi mengenali sekuens nukleotida palindromik spesifik dalam DNA. Palindrom dalam DNA adalah urutan pasangan basa yang terbaca sama pada dua untai ketika orientasi pembacaan tetap sama. Misalnya, urutan berikut dibaca sama pada dua untai dalam arah 5′ – 3′. 5′ GAATTC 3′ dan 3′ CTTAAG 5′. Enzim restriksi memotong untai DNA agak jauh dari pusat situs palindrom, tetapi antara dua basa yang sama pada untai yang berlawanan. Ini meninggalkan bagian beruntai tunggal di ujungnya. Ada bentangan menjorok yang disebut ujung lengket pada setiap helai.

Soal: Eco RI, Eco RV dan Sac I merupakan jenis enzim restriksi. Tiga jenis termini dapat dihasilkan.(1) ujung terhuyung 5′, (2) ujung tumpul, dan (3) ujung terhuyung 3′. Yang penting, ujung 5′ dari setiap untai dalam produk pembelahan mempertahankan gugus fosforil dari ikatan fosfo diester, ujung 3′ dihidroksilasi. Berikut adalah tindakan mereka diberikan. Manakah dari jawaban berikut yang benar?

A» Semua ini menghasilkan ujung yang lengket.

B» Semuanya menghasilkan ujung yang tumpul.

C» Masing-masing dapat menghasilkan ujung yang lengket dan tumpul.

D» Semuanya bekerja pada barisan palindromik.