- Urutan nukleotida palindromik dari EcoR I adalah
5′ GAATTC 3′
3′ CTTAAG 5′
- Setiap fungsi endonuklease restriksi dengan ‘memeriksa’ panjang sekuens DNA. Setelah menemukan urutan pengenalan spesifiknya, ia akan mengikat DNA dan memotong masing-masing dari dua untai heliks ganda pada titik-titik tertentu di tulang punggung gula-fosfat mereka. Setiap restriksi endonuklease mengenali urutan nukleotida palindromik tertentu dalam DNA. Enzim restriksi memotong tegakan DNA antara dua basa yang sama pada untai yang berlawanan. Ada bentangan menjorok yang disebut ujung lengket pada setiap helai. Mereka membentuk ikatan hidrogen dengan rekan potong komplementer mereka. Kelengketan ujung ini memfasilitasi aksi enzim DNA ligase.
Soal: Eco RI digunakan untuk memotong segmen DNA asing dan DNA vektor untuk membentuk DNA rekombinan. Tunjukkan dengan bantuan diagram skematik.(i) Himpunan urutan nukleotida palindromik dari pasangan basa Eco RI-akan mengenali di kedua segmen DNA. tandai tempat di mana Eco RI akan bertindak dan potong kedua segmen., (ii) Ujung lengket terbentuk pada kedua segmen di mana kedua segmen DNA akan bergabung nanti untuk membentuk DNA rekombinan.
