Seleksi buatan digunakan untuk meningkatkan kesehatan dan kesejahteraan populasi global atau untuk meningkatkan kesehatan dan kesejahteraan individu. Namun, manfaat atau kerugian dari faktor lain yang berkaitan dengan hasil seleksi buatan sering dilupakan.
Ekosistem pertanian yang menampilkan tanaman tahan hama dan jamur, pada prinsipnya, akan menggunakan lebih sedikit pestisida. Pengenalan ikan yang dimodifikasi secara genetika yang kecil kemungkinannya menyerap logam-logam berat ke dalam daging mereka ke lautan dapat meneruskan gen-gen ini ke populasi liar dan meningkatkan laju reproduksi keseluruhan spesies.
Pohon-pohon yang dipilih secara artifisial dapat menghuni kembali hutan dengan laju yang jauh lebih cepat. Dan kemungkinan untuk menghilangkan Dengue dan malaria melalui seleksi buatan nyamuk steril menjadi kurang fiktif. Seleksi buatan dalam ekosistem mikroba bahkan mungkin menghasilkan mikroorganisme yang berhasil mencerna mikroplastik yang mengotori lautan. Oleh karena itu jelas bahwa seleksi buatan memiliki tempat yang penting sekarang, dan di masa depan.
Namun, seleksi buatan juga dapat digunakan untuk efek merusak. Seringkali, itu adalah kualitas hidup dari spesies yang dipilih secara artifisial yang terpengaruh, seperti infeksi pernapasan dan hipoksia pada anjing berhidung pendek, dan pingsan pada kambing. Seleksi buatan juga sangat mengurangi jumlah variasi dalam gen pool – bidang gandum modern mengandung hanya itu, bukan campuran besar rumput liar dan bunga padang rumput yang dikenal sebagai ladang gandum abad pertengahan. Ini berdampak negatif terhadap keanekaragaman hayati suatu ekosistem. Perkawinan sedarah dapat memperpendek rentang hidup atau menyebabkan keturunan mengembangkan masalah kesehatan serius yang seringkali tidak ditemukan sampai terlambat.
Masalah utama dengan etika seleksi buatan adalah sama dengan masalah etika – siapa yang memutuskan mana yang benar dan mana yang tidak? Seberapa pentingkah jenis kucing datang dalam tiga warna atau empat? Apakah penting jika, dengan menghilangkan satu hama melalui seleksi buatan, kita menawarkan kondisi yang tepat untuk radiasi adaptif oportunistik dari hama lain? Apakah penciptaan satu tanaman global bijaksana, bahkan jika tanaman ini mengakhiri kelaparan dalam skala global? Apa yang akan terjadi jika hama menghancurkan tanaman itu? Dan bagaimana para ilmuwan dapat yakin bahwa adaptasi satu alel tidak akan menghasilkan mutasi berbahaya lebih lanjut ke depan? Seleksi buatan jauh dari konsep baru, tetapi kemajuan terbaru dalam bioteknologi berarti metode pengendalian spesies ini suatu hari akan memiliki kekuatan untuk tidak hanya mengubah setiap organisme tetapi juga untuk mempengaruhi spesiasi itu sendiri.
