Sel prokariorik adalah sel yang belum mempunyai inti sejati (pro — sebelum, karyon — Inti atau nukleus). Makhluk hidup Kingdom Monera dan Protista terdiri atas satu sel tetapi berbeda dalam struktur intinya.

Bakteri merupakan contoh dan Monera yang bersifat prokariotik, sedangkan Protozoa bersifat eukariiotik adalah contoh dan Protista. Apabila dilihat dengan menggunakan mikroskop elektnon dapat dijumpai beberapa ciri-ciri khusus sel bakterii beriikut ini.

Ciri-ciri sel prokariotik adalah bahan genetik (DNA) tidak terstruktur dalam bentuk nukleus. DNA terdapat pada nuclear area’ atau nukleoid tidak diselubungi oleh membran. Pada mikroskop elektron tampak sebagai daerah tebal dan gelap.

Kromosom pada bakteri berbentuk sirkuler, tidak mempunyai nukleolus, dan retikulum endoplasma berupa mesosom, umumnya berukuran kecil, lebih kecil dan sel eukaniotik, kecuali bakteni Epulofiscium fishelsoni (650 milimikron) dan Thiomargaritta namimbiensis (800 milimikron) (Campbell, 2003: 116).