Indonesia mempunyai keragaman spesies baik hewan dan tumbuhan yang berbeda antara bagian barat dan timur. Biogeografi adalah ilmu yang mempelajari tentang asal penyebaran makhluk hidup di permukaan bumi. Ilmuwan yang pertama kali mengemukakan adanya hubungan antara makhluk hidup dengan Iingkungan di permukaan burni adalah Alfred Wallace. Hewan-hewan Indonesia Bagian Barat Ciri-cirinya antara lain:

1. Banyak mamalia berukuran besar. Contoh: gajah, banteng, dan harimau.
2. Terdapat berbagai macam kera
3. Terdapat hewan endemik, yaitu: badak bercula satu, monyet, kukang, dan binturong.
4. Burung-burung yang memiliki warna bulu kurangmenarik dibanding daerah Australian.

Hewan-hewan Indonesia Bagian Timur Ciri-cirinya antara lain:

1. Mamalia berukuran kecil.
2. Banyak hewan berkantung.
3. Tidak terdapat spesies kera
4. Warna burung-burung lebih menarik.

Hewan Daerah Peralihan

Contohnya adalah daerah Sulawesi yang hewan-hewannya mirip dengan daerah Australia.