Dalam translasi mRNA dibaca sebagai kodon sedangkan tRNA tidak. RNA transfer memiliki antikodon, tapi mRNA tidak memiliki. transfer RNA atau tRNA membawa asam amino ke ribosom dan berinteraksi dengan mRNA dalam translasi sintesis protein, dan urutan mRNA ditranskripsi dari template DNA yang sama seperti replikasi DNA dan menkode untuk urutan asam amino dari protein.

Struktur molekul mRNA linear dilipat sedangkan tRNA molekul adalah struktur 3-D yang berisi beberapa loop seperti jepit rambut. Pada salah satu ujung tRNA, ia memiliki CCA trinukleotida yang umum untuk semua molekul tRNA tapi mRNA tidak memiliki karakteristik tersebut. Dalam sel, tRNA diproduksi sebagian besar disebabkan ada setidaknya satu jenis tRNA untuk setiap asam amino. Jadi, dibandingkan dengan jumlah tRNA, jumlah mRNA yang lebih rendah.