Biodegradasi adalah proses alami di mana jamur, bakteri atau organisme biologis lainnya memecah bahan. Setelah biodegradasi penuh, bahan dipecah menjadi molekul komponennya. Istilah ini sering diterapkan pada topik pengelolaan limbah, biomedis, dan remediasi lingkungan alami.

Biodegradasi produk limbah dan limbah kimia sangat penting dalam pengelolaan limbah dan risiko. Sebagai contoh, produsen eter glikol yang digunakan dalam pelarut, cat dan pembersih harus menentukan persentase biodegradasi yang dapat dicapai dari waktu ke waktu. Dengan mengetahui kualitas biodegradasi zat beracun atau berbahaya, penilai risiko dan manajer limbah dapat menentukan strategi yang tepat dan langkah-langkah keamanan yang berlaku untuk pembuangan bahan kimia dan bahan. Biodegradasi juga dapat dimanipulasi seperti dalam kasus bencana tumpahan minyak Exxon Valdez di mana nitrogen, fosfor dan besi digunakan untuk mempercepat biodegradasi minyak oleh mikroorganisme.